Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion

Nienaruszalność endoteliny może sprzyjać ewolucji nowotworu i adaptacji oraz hamować strategie medycyny spersonalizowanej, które zależą od wyników pojedynczych próbek z biopsji guza. Metody
Aby zbadać heterogeniczność śródmózgowia, wykonaliśmy sekwencjonowanie exome, analizę aberracji chromosomowych i profilowanie ploidalne na wielu oddzielonych przestrzennie próbkach uzyskanych z pierwotnych nowotworów nerek i związanych z nimi miejsc przerzutów. Scharakteryzowaliśmy konsekwencje heterogenności wewnątrznaczyniowej za pomocą analizy immunohistochemicznej, analizy funkcjonalnej mutacji i profilowania ekspresji RNA informacyjnego.
Wyniki
Rekonstrukcja filogenetyczna ujawniła rozgałęziony ewolucyjny wzrost guza, z 63 do 69% wszystkich mutacji somatycznych niewykrywalnych w każdym regionie guza. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion”

Radykalna prostatektomia a obserwacja w przypadku miejscowego raka prostaty AD 10

Pozytywne wyniki pochodzą z wielu porównań podgrup; testy interakcji zwykle zbliżają się, ale nie osiągają znaczenia, a zatem mogą być wynikiem przypadku. Wśród mężczyzn z poziomami PSA 10 ng na mililitr lub mniej, śmiertelność z wszystkich przyczyn była nieco niższa po 12 latach w grupie obserwacyjnej niż w grupie radykalnej prostatektomii; Śmiertelność gruczołu krokowego w grupie obserwacyjnej wynosiła 6%, przy nieistotnym absolutnym zmniejszeniu o mniej niż 1,0 punkt procentowy w grupie radykalnej prostatektomii. Wśród mężczyzn z chorobą niskiego ryzyka obserwacja była związana z nieistotną redukcją umieralności z powodu wszystkich przyczyn i raka prostaty, bez znaczącej różnicy między grupami w przerzutach do kości. Wśród mężczyzn o wartości PSA przekraczającej 10 ng na mililitr i prawdopodobnie wśród osób z umiarkowanym ryzykiem raka prostaty lub wysokiego ryzyka (ustalonych na podstawie wartości PSA, lokalnych badań histologicznych i stopnia zaawansowania), bezwzględne zmniejszenie śmiertelność z radykalną prostatektomią wahała się od 6,7 do 13,2 punktów procentowych. Read more „Radykalna prostatektomia a obserwacja w przypadku miejscowego raka prostaty AD 10”

Radykalna prostatektomia a obserwacja w przypadku miejscowego raka prostaty AD 9

Najczęstszym powikłaniem jest infekcja ran u 4,3% mężczyzn=. Powikłania występujące u ponad 2% mężczyzn obejmowały zakażenie układu moczowego, naprawę chirurgiczną, krwawienie wymagające transfuzji i cewnikowanie dróg moczowych ponad 30 dni po operacji. Po 2 latach od pacjentów zgłaszających nietrzymanie moczu i zaburzenia erekcji, ale nie dysfunkcje jelit, były znacznie częstsze wśród mężczyzn, którzy zostali losowo przydzieleni do radykalnej prostatektomii niż wśród losowo przydzielonych do obserwacji (Tabela 2). Dyskusja
Wśród mężczyzn z klinicznie umiejscowionym rakiem gruczołu krokowego, którzy zostali zdiagnozowani po testach PSA, nasze badanie wykazało, że radykalna prostatektomia nie zmniejszyła umieralności z powodu wszystkich przyczyn ani raka prostaty, w porównaniu z obserwacją, przez co najmniej 12 lat obserwacji. Read more „Radykalna prostatektomia a obserwacja w przypadku miejscowego raka prostaty AD 9”

Cewa rdzeniowa

Cewa rdzeniowa stanowi zaczątek, z którego rozwinie się w przyszłości – mózgowie(encephalon) na przedzie, a –rdzeń kręgowy (medulla spinalis) w tyle. W miejscu oderwania się cewy rdzeniowej od ektodermy powierzchownej część komórek wędruje ha boki cewy, tworząc tam po każdej stronie-listewkę zwojową. Część komórek listewki tworzy na miejscu zawiązki ułożonych odcinkowo – zwojów rdzeniowych, inne zaś wędrują w kierunku brzusznym, pod strunę grzbietową, dając początek zwojom współczulnym podkręgowym i obwodowym i wreszcie część komórek wyróżnicowuje się w postaci zaczątka – istoty rdzennej nadnercza. Powracając do opisu cewy rdzeniowej należy zaznaczyć, że początkowo posiada ona ściany nader cienkie i bardzo obszerne światło, które już obecnie możemy nazwać-przewodem ośrodkowym. Jedyna warstwa komórek cylindrycznych, tworząca ścianę cewy, przekształca się, wskutek licznych podziałów, w nabłonek wielowarstwowy, wywołujący oczywiście zgrubienie ścian i przewężenie światła przewodu ośrodkowego. Read more „Cewa rdzeniowa”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 7

Regiony zawierające mTOR typu dzikiego nie miały barwienia fosfo-S6 i fosfo-4EBP w komórkach nowotworowych. Panel B pokazuje immunoblotting komórek Caki1 (pochodzących z ludzkiego raka nerkowokomórkowego), które przejściowo transfekowano samym wektorem z białkiem zielonej fluorescencji (GFP), GFP-mTOR (typ dziki) lub GFP-mTOR (L2431P) z i bez głodu w surowicy. Panel C pokazuje hierarchiczne grupowanie próbek na podstawie genów sygnatur prognostycznych dwóch podgrup molekularnych: jasnych komórek A (ccA), które wskazują dobre rokowanie, oraz jasnych komórek B (ccB), co wskazuje na złe prognozy. Miejsca przerzutowe (M2a i M2b) i miejsce R4 pierwotnego nowotworu segregowały się razem, wzbogacone o geny w podgrupie z czystych komórek A, w przeciwieństwie do pozostałych regionów nowotworowych, które zostały wzbogacone w podgrupę z czystych komórek B, pokazując ten gen. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 7”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 6

Obszary guza poddano detekcji allelicznej i braku arytmii na podstawie macierzy SNP w celu identyfikacji aberracji chromosomowych. Próbki pierwotnego guza z przerzutami i przerzuty zostały wykluczone z powodu niedostatecznego DNA, a R1, R3 i R5 nie spełniały kontroli jakości. Skrawki nierównowagi alleli na chromosomie 3p były jedynymi wszechobecnymi nieprawidłowościami (ryc. 5A w dodatkowym dodatku). Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 6”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 5

Częstotliwości wariancji w danych z sekwencjonowania ultradźwięków R4 ujawniły, że mutacje współdzielone z miejscami przerzutowymi wykryto przy wyższych częstotliwościach niż mutacje dzielone z innymi regionami guza pierwotnego, dodatkowo potwierdzając obecność dwóch subklonów w R4. (Aby uzyskać wstępną analizę filogenetyczną synonimicznych mutacji, zobacz Rysunek 3 w Dodatku Dodatkowym). Pojedyncza biopsja wykazała średnio 70 mutacji somatycznych, około 55% wszystkich mutacji wykrytych w tym guzie. Tylko 34% wszystkich mutacji, które zostały wykryte przez sekwencjonowanie multiregionu w próbce nefrektomii, było obecne we wszystkich regionach (31%, jeśli włączono próbki do wstępnego leczenia i metastazektomii), co wskazuje, że pojedyncza biopsja nie była reprezentatywna dla krajobrazu mutacji całego guza. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 5”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 4

Sekwencjonowanie spowodowało medianę obejmującą 74 odczyty. Niesynonimowe mutacje punktowe somatyczne oraz insercje i delecje (indele), które zmieniają sekwencję aminokwasową białek, zostały przefiltrowane i ręcznie przeanalizowane w celu usunięcia błędów sekwencjonowania i wyrównania oraz określenia regionalnego rozkładu mutacji. Regiony R6 i R7 zostały wyłączone z analiz, ponieważ tylko jeden niesynonimiczny wariant przeszedł filtrowanie. Zidentyfikowaliśmy 101 niesynonimowych mutacji punktowych i 32 indeli (Tabela 2 w dodatkowym dodatku) i zmapowaliśmy ich regionalne rozkłady w poprzek guza (Figura 2B). Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 4”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 3

SekwPo 6 tygodniach leczenia ewerolimusem i 1-tygodniowym okresem wymywania przeprowadzono nefrektomię. Pacjent ponownie uruchomił ewerolimus przez 6 tygodni i po kolejnym 1-tygodniowym okresie wymywania przystąpił do operacji masy klatki piersiowej. Tomografia komputerowa (CT) nie ujawniła żadnej zmiany wymiarów guza pierwotnego ani przerzutów w ścianie klatki piersiowej podczas leczenia ewerolimusem. Identyfikacja i walidacja mutacji somatycznych
Rycina 2. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 3”

Pertuzumab z trastuzumabem i docetaksel w leczeniu przerzutowego raka piersi AD 3

Stan HER2-pozytywny potwierdzono centralnie, za pomocą immunohistochemii (z 3+ wskazującym status pozytywny) lub fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (ze współczynnikiem amplifikacji .2,0 oznaczającym status pozytywny) . Pacjenci kwalifikowali się, niezależnie od tego, czy mieli mierzalną chorobę czy chorobę nie-mierzalną. Stan receptora hormonalnego guza określono miejscowo. Dodatkowe kryteria kwalifikacyjne to wiek 18 lat lub starszy, frakcja wyrzutowa lewej komory w wysokości 50% lub więcej na początku badania (określona za pomocą echokardiografii lub skanowanie bramek wielokrotnych bramkowanych) oraz Stan wydajności grup wschodni Cooperative Oncology (ECOG) 22 0 lub (przy czym 0 wskazuje, że pacjent jest w pełni aktywny i jest w stanie wykonywać wszystkie czynności z predisease bez ograniczeń i wskazuje, że pacjent jest ograniczony fizycznie, ale jest ambulatoryjny i może wykonywać pracę o charakterze lekkim lub siedzącym). Read more „Pertuzumab z trastuzumabem i docetaksel w leczeniu przerzutowego raka piersi AD 3”