Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 5

Częstotliwości wariancji w danych z sekwencjonowania ultradźwięków R4 ujawniły, że mutacje współdzielone z miejscami przerzutowymi wykryto przy wyższych częstotliwościach niż mutacje dzielone z innymi regionami guza pierwotnego, dodatkowo potwierdzając obecność dwóch subklonów w R4. (Aby uzyskać wstępną analizę filogenetyczną synonimicznych mutacji, zobacz Rysunek 3 w Dodatku Dodatkowym). Pojedyncza biopsja wykazała średnio 70 mutacji somatycznych, około 55% wszystkich mutacji wykrytych w tym guzie. Tylko 34% wszystkich mutacji, które zostały wykryte przez sekwencjonowanie multiregionu w próbce nefrektomii, było obecne we wszystkich regionach (31%, jeśli włączono próbki do wstępnego leczenia i metastazektomii), co wskazuje, że pojedyncza biopsja nie była reprezentatywna dla krajobrazu mutacji całego guza. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 5”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 4

Sekwencjonowanie spowodowało medianę obejmującą 74 odczyty. Niesynonimowe mutacje punktowe somatyczne oraz insercje i delecje (indele), które zmieniają sekwencję aminokwasową białek, zostały przefiltrowane i ręcznie przeanalizowane w celu usunięcia błędów sekwencjonowania i wyrównania oraz określenia regionalnego rozkładu mutacji. Regiony R6 i R7 zostały wyłączone z analiz, ponieważ tylko jeden niesynonimiczny wariant przeszedł filtrowanie. Zidentyfikowaliśmy 101 niesynonimowych mutacji punktowych i 32 indeli (Tabela 2 w dodatkowym dodatku) i zmapowaliśmy ich regionalne rozkłady w poprzek guza (Figura 2B). Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 4”

Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 3

SekwPo 6 tygodniach leczenia ewerolimusem i 1-tygodniowym okresem wymywania przeprowadzono nefrektomię. Pacjent ponownie uruchomił ewerolimus przez 6 tygodni i po kolejnym 1-tygodniowym okresie wymywania przystąpił do operacji masy klatki piersiowej. Tomografia komputerowa (CT) nie ujawniła żadnej zmiany wymiarów guza pierwotnego ani przerzutów w ścianie klatki piersiowej podczas leczenia ewerolimusem. Identyfikacja i walidacja mutacji somatycznych
Rycina 2. Read more „Ewolucja rozgałęzień ujawniona przez sekwencjonowanie Multiregion AD 3”

Pertuzumab z trastuzumabem i docetaksel w leczeniu przerzutowego raka piersi AD 3

Stan HER2-pozytywny potwierdzono centralnie, za pomocą immunohistochemii (z 3+ wskazującym status pozytywny) lub fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (ze współczynnikiem amplifikacji .2,0 oznaczającym status pozytywny) . Pacjenci kwalifikowali się, niezależnie od tego, czy mieli mierzalną chorobę czy chorobę nie-mierzalną. Stan receptora hormonalnego guza określono miejscowo. Dodatkowe kryteria kwalifikacyjne to wiek 18 lat lub starszy, frakcja wyrzutowa lewej komory w wysokości 50% lub więcej na początku badania (określona za pomocą echokardiografii lub skanowanie bramek wielokrotnych bramkowanych) oraz Stan wydajności grup wschodni Cooperative Oncology (ECOG) 22 0 lub (przy czym 0 wskazuje, że pacjent jest w pełni aktywny i jest w stanie wykonywać wszystkie czynności z predisease bez ograniczeń i wskazuje, że pacjent jest ograniczony fizycznie, ale jest ambulatoryjny i może wykonywać pracę o charakterze lekkim lub siedzącym). Read more „Pertuzumab z trastuzumabem i docetaksel w leczeniu przerzutowego raka piersi AD 3”